Bilgisayar Mühendisliği yüksek lisans ve doktora programları İTÜ Lisansüstü Eğitim Merkezi'ne bağlı olarak yürütülmektedir. Bu programlar hakkında güncel bilgilere aşağıdaki adresler üzerinden ulaşabilirsiniz;

Bilgisayar Mühendisliği Tezli Yüksek Lisans Programı
Bilgisayar Mühendisliği Doktora Programı

Bilgisayar Mühendisliği lisansüstü programları için belirlenen bilimsel hazırlık dersleri aşağıdaki gibidir;

Güz Dönemi

Bahar Dönemi

BLG 223E: Data Structures 
BLG 336E: Analysis of Algorithms 2
BLG 212E: Microprocessor Systems 
BLG 312E: Computer Operating Systems
BLG 231E: Digital Circuits  BLG 311E: Formal Languages and Automata